1999年，坠落地球的巨大陨石夺去了整个海洋。与此同时，地球外生物WORM亦开始在世界各地繁殖。为了对抗在一瞬间支配了广泛地区的WORM，人类成立了对WORM组织ZECT。ZECT开发出幪面超人系统，投入战场与WORM展开激战，时间就在这场战争中渡过了七年。2006年，在这个沙漠化的地球上，部分ZE